La sezione è dotata dei seguenti sistemi ed attrezzature:

• Sistemi automatizzati per la coltura di microrganismi aerobi e anaerobi
• Microscopi per osservazione in campo chiaro e fluorescenza e microscopio elettronico a scansione, tutti dotati di sistemi di acquisizione ed elaborazione d’immagine
• PCR qualitativa e quantitativa
• Caratterizzazione molecolare di popolazioni batteriche e fungine (ITS 16S-23S, BOX-PCR, ARDRA, tRNA-PCR fingerprinting, rep-PCR fingerprinting)
• Camere climatiche per l’allevamento di piante, funghi, batteri e insetti
• Piattaforma bioinformatica (per lo studio del genoma dei procarioti e 16S rRNA barcoding)
• Inductively coupled mass spectrometry (ICP-MS)
• Reattori per biofilm
• Attrezzatura per Filth test
• Attrezzature per la valutazione dell’efficacia biologica di fungicidi di sintesi, naturali e prodotti da microrganismi